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Schulung UniProt: Analyse und Optimierung von Proteinsequenzdaten
Praxisorientierte Übungen zur Proteinsequenzanalyse
Schulungsformen
Inhouse-/Firmenschulung
- 3 Tage - anpassbar
- Termin nach Wunsch
- Preis nach Angebot
- In Ihrem Hause oder bei der GFU
- Online, Präsenz oder Hybrid
- Lernumgebung in der Cloud
Individualschulung
- 3 Tage - anpassbar
- Termin nach Wunsch
- Preis nach Angebot
- In Ihrem Hause oder bei der GFU
- Online, Präsenz oder Hybrid
- Lernumgebung in der Cloud
Beschreibung
In diesem Seminar lernen die Teilnehmenden die grundlegenden und fortgeschrittenen Techniken zur Nutzung von UniProt für die Proteinsequenz- und Funktionsanalyse kennen. Der Fokus liegt auf der Erstellung, Optimierung und Analyse von Proteinsequenzdaten sowie der Integration moderner Technologien, einschließlich Scripting und Automatisierung. Die Teilnehmer werden sich mit den grundlegenden und erweiterten Tools von UniProt vertraut machen und durch praxisorientierte Übungen die erlernten Konzepte anwenden.
Schulungsziel
Am Ende des Seminars sind die Teilnehmenden in der Lage, UniProt effektiv zu nutzen, um Proteinsequenzen zu analysieren, zu optimieren und zu verwalten. Sie lernen, wie sie die Effizienz und Qualität ihrer Datenabfragen und Analysen verbessern können.
Details
Wer teilnehmen sollte
Dieses Seminar richtet sich an Bioinformatiker, Molekularbiologen, Biochemiker und technische Fachkräfte, die ihre Kenntnisse mittels Einsatz von UniProt für die Proteinsequenzanalyse vertiefen und optimieren möchten. Grundlegende Kenntnisse in Bioinformatik und molekularer Biologie sind erforderlich.
Ihre Schulung
Präsenz-Schulung | Online-Schulung |
|---|---|
| Lernmethode | |
Ausgewogene Mischung aus Theorie und Praxis | Wie auch bei unseren Präsenz-Seminaren: Ausgewogene Mischung aus Theorie und praktischen Übungen. Trainer durchgehend präsent. |
| Unterlagen | |
Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive. Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne. | Seminarunterlagen oder Fachbuch inklusive (per Post). Das Fachbuch wählt der Trainer passend zum Seminar aus - Ihren individuellen Buch-Wunsch berücksichtigen wir auf Nachfrage gerne. |
| Arbeitsplatz | |
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| Lernumgebung | |
Neu aufgesetzte Remote-Systeme für jeden Kurs in Abstimmung mit dem Seminarleiter, sodass Sie über ein perfektes Setup für die Durchführung aller praktischen Übungen verfügen. | |
| Arbeitsmaterialien | |
Din A4 Block, Notizblock, Kugelschreiber, USB-Stick, Textmarker, Post-its | |
| Teilnahmezertifikat | |
Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen am Ende des Seminars ausgehändigt. | Die Teilnahmezertifikat inkl. Inhaltsverzeichnis wird Ihnen per Post zugesandt. |
Organisation
Präsenz-Schulung | Online-Schulung | |
|---|---|---|
| Teilnehmendenzahl | ||
min. 1, max. 8 Personen | ||
| Garantierte Durchführung * | ||
Ab 1 Teilnehmenden | ||
| Schulungszeiten | ||
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| Ort der Schulung | ||
 GFU SchulungszentrumAm Grauen Stein 27 51105 Köln-Deutz oder online im Virtual Classroom oder europaweit bei Ihnen als Inhouse-Schulung Um ein optimales Raumklima zu gewährleisten, haben wir das Schulungszentrum mit 17 hochmodernen Trotec TAC V+ Luftreinigern ausgestattet. Diese innovative Filtertechnologie (H14 zertifiziert nach DIN EN1822) sorgt dafür, dass die Raumluft mehrfach pro Stunde umgewälzt wird und Schadstoffe zu 99.995% im HEPA-Filter abgeschieden und infektiöse Aerosole abgetötet werden. Zusätzlich sind alle Räume mit CO2-Ampeln ausgestattet, um jederzeit eine hervorragende Luftqualität sicherzustellen. | ||
| Räumlichkeiten | ||
Helle und modern ausgestattete Räume mit perfekter Infrastruktur | Bequem aus dem Homeoffice von überall | |
| All-Inclusive | ||
Frühstück, Snacks und Getränke ganztägig, Mittagessen im eigenen Restaurant, täglich 6 Menüs, auch vegetarisch | Eine Auswahl unserer Frühstücks-Snacks und Nervennahrungs-Highlights senden wir Ihnen mit den Seminarunterlagen per Post zu. | |
| Barrierefreiheit | ||
Das GFU-Schulungszentrum (Am Grauen Stein 27) ist barrierefrei | - | |
Kostenfreie Services
Präsenz-Schulung | Online-Schulung |
|---|---|
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Inhalt
- Einführung in UniProt: Überblick und Bedeutung
- Was ist UniProt und warum ist es wichtig?
- Definition und Hintergrund: UniProt als umfassende Proteinsequenz- und Funktionsdatenbank.
- Bedeutung und Vorteile: Unterstützung der biowissenschaftlichen Forschung, umfassende Datensätze, hohe Qualität und Genauigkeit.
- Vergleich mit ähnlichen Tools: Unterschiede und Vorteile gegenüber GenBank, PDB und Pfam.
- Was ist UniProt und warum ist es wichtig?
- Grundlagen der UniProt-Website und -Datenbanken
- Navigieren auf der UniProt-Website
- Einführung in die Benutzeroberfläche: Navigationsmenü, Suchfunktionen, Datenzugriff.
- Erstellen und Verwalten von Abfragen: Basis- und erweiterte Suchoptionen.
- Überblick über die UniProt-Datenbanken: UniProtKB/Swiss-Prot, UniProtKB/TrEMBL, UniRef, UniParc.
- Navigieren auf der UniProt-Website
- Grundlegende Funktionen und Bedienung
- Datenabfrage und -visualisierung
- Importieren und Exportieren von Daten: Formate, Tools und Methoden.
- Visualisierung von Proteinsequenzen und -strukturen: Tools und Techniken.
- Nutzung von Annotationen und Metadaten: Interpretieren und Anwenden von Daten.
- Datenabfrage und -visualisierung
- Erste Schritte mit UniProt
- Einfache Datenabfragen und Analysen
- Durchführung von Sequenzsuchen: BLAST, HMMER.
- Analyse von Proteinsequenzen: Homologie, Domänen, Motive.
- Nutzung von UniProt-Tools: ProtParam, ProtScale, Align.
- Einfache Datenabfragen und Analysen
- Praxisübung 1: Abfrage und Analyse von Proteinsequenzen
- Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Abfrage und Analyse von Proteinsequenzen.
- Projektbeschreibung: Teilnehmer erstellen Abfragen und analysieren eine Proteinsequenz mithilfe von UniProt-Tools.
- Anforderungen: Nutzung der grundlegenden Funktionen und Tools von UniProt.
- Schritt-für-Schritt-Anleitung:
- Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
- Durchführung: Erstellung von Abfragen, Analyse der Proteinsequenzen, Nutzung der Tools.
- Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
- Tools: UniProt-Website, ProtParam, BLAST.
- Ergebnisse und Präsentation:
- Präsentation der durchgeführten Abfragen und Analysen.
- Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.
- Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Abfrage und Analyse von Proteinsequenzen.
- Vertiefte Analyse und Datenintegration
- Erweiterte Such- und Analysetechniken
- Nutzung von erweiterten Suchparametern: Filtern und Verfeinern von Suchergebnissen.
- Integration von externen Datenquellen: Verknüpfung von UniProt-Daten mit anderen Datenbanken (z.B. PDB, KEGG).
- Analyse komplexer Datensätze: Multidimensionale Analysen, Netzwerkanalysen.
- Erweiterte Such- und Analysetechniken
- Integration und Datenmanagement
- Integration mit bioinformatischen Tools und Pipelines
- Anbindung an Analyse-Tools: Nutzung von Jupyter Notebooks, R und Python für Datenanalysen.
- Datenmanagement und -synchronisierung: Verwaltung von Datenflüssen und -integrität.
- Datenschutz und Compliance: Einhaltung von Datenschutzbestimmungen und Sicherheitsstandards.
- Integration mit bioinformatischen Tools und Pipelines
- Scripting und Automatisierung
- Automatisierung von Abfragen und Analysen
- Einführung in die UniProt REST API: Grundlagen und Nutzung.
- Erstellung von Skripten zur Automatisierung: Python, R.
- Erweiterte Scripting-Techniken: Batch-Verarbeitung, Schleifen, Bedingungen.
- Automatisierung von Abfragen und Analysen
- Analyse und Optimierung von Datenabfragen
- Überwachung und Fehlersuche
- Überwachung und Analyse der Abfragequalität: Nutzung von Dashboards und Berichten.
- Protokollierung und Fehlersuche: Methoden zur Fehleranalyse und -behebung.
- Optimierung von Abfragen: Durchführung von Tests, Analyse der Ergebnisse, kontinuierliche Verbesserung.
- Überwachung und Fehlersuche
- Praxisübung 2: Erstellung und Automatisierung komplexer Datenabfragen
- Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Erstellung und Automatisierung komplexer Datenabfragen.
- Projektbeschreibung: Teilnehmer erstellen und automatisieren komplexe Abfragen mithilfe der UniProt REST API.
- Anforderungen: Nutzung der erweiterten Funktionen und Scripting-Tools von UniProt.
- Schritt-für-Schritt-Anleitung:
- Vorbereitung: Einführung in die Projektanforderungen, Einrichtung der Umgebung.
- Durchführung: Erstellung der Abfragen, Integration von Skripten, Analyse der Ergebnisse.
- Präsentation: Vorstellung der Ergebnisse durch die Teilnehmer.
- Tools: UniProt REST API, Python, Jupyter Notebook.
- Ergebnisse und Präsentation:
- Präsentation der erstellten Abfragen und der durchgeführten Automatisierungen.
- Diskussion und Feedback: Analyse der Ergebnisse und Verbesserungsvorschläge.
- Ziel der Übung: Anwendung der erlernten Techniken zur Erstellung und Automatisierung komplexer Datenabfragen.
Buchungsmöglichkeiten
Online oder in Präsenz teilnehmen
Sie können sowohl Online als auch in Präsenz am Seminar teilnehmen. Klicken Sie bei Ihrer Buchung oder Anfrage einfach die entsprechende Option an.
Inhalte werden auf Wunsch an die Anforderungen Ihres Teams angepasst.
- Online, Präsenz oder Hybrid
- Komplette Lernumgebung in der Cloud mit Remote Zugriff
Fokus aufs Fachliche und maximaler Raum für individuelle Fragen.
- Online, Präsenz oder Hybrid
- Komplette Lernumgebung in der Cloud mit Remote Zugriff
Was bedeutet Offene Schulung und Inhouse Schulung?
Bei einer offenen Schulung stehen Ort und Termin vorab fest. Jeder Interessent kann eine offene Schulung buchen, daher treffen Teilnehmer aus verschiedenen Unternehmen aufeinander.
Inhouse Schulungen können auf Ihren individuellen Schulungsbedarf zugeschnitten werden. Sie bestimmen den Teilnehmerkreis, Termin und Schulungsort.
Ist eine Inhouse Schulung die richtige Wahl?
Bei einer Inhouse Schulung gehen wir auf die individuellen Bedürfnisse Ihres Unternehmens ein und decken den Schulungsbedarf direkt bei Ihnen im Unternehmen ab.
Das spart Zeit und Geld und sorgt für einen schnellen Wissenstransfer Ihrer Mitarbeiter.
Wer kümmert sich um die Technik bei Inhouse Schulungen?
Eine komplette Lernumgebung in der Cloud mit Remote Zugriff ist für uns selbstverständlich. Sie müssen sich um nichts kümmern. Lediglich ein funktionierender PC oder Notebook mit Internetanschluss sollte für jeden Teilnehmer am Schulungstag bereit stehen.
Vorteile einer Inhouse Schulung
- Kompetente Seminarberatung
- Dozenten aus der Praxis
- Auf Ihre Bedürfnisse zugeschnittener individueller Lernstoff
- Sie können den Termin flexibel gestalten, so wie es für Sie am besten passt
- Unsere Inhouse Schulungen können Europaweit durchgeführt werden
- Der Fokus liegt auf Ihrem Schulungsbedarf, somit schonen Sie Ihr Budget
- Wissenslücken Ihrer Mitarbeitet werden schnell geschlossen